El componente de Monitoreo Institucional del Agua busca fortalecer la generación de información confiable sobre disponibilidad, calidad, usos y riesgos hídricos para apoyar la toma de decisiones basadas en evidencia y fomentar la articulación entre autoridades ambientales, sectores productivos y comunidades. Sus ejes de trabajo incluyen: el apoyo a instrumentos nacionales de monitoreo, el fortalecimiento de capacidades regionales, el análisis de políticas sobre reúso y recirculación del agua, y los intercambios técnicos nacionales e internacionales. Entre los principales resultados se destaca la participación en el Estudio Nacional del Agua 2022, liderado por el IDEAM, mediante aportes técnicos en los capítulos de usos y calidad, la elaboración de notas sectoriales (hidrocarburos y agrícola) y la socialización nacional del estudio, que convocó a 357 personas. Asimismo, se acompañó la formulación e implementación de Programas Institucionales Regionales de Monitoreo del Agua (PIRMA) con varias autoridades ambientales (Corpochivor, Corpocaldas, Corpoamazonía, entre otras), y se realizó el Encuentro Nacional de Monitoreo Institucional del Agua con 32 autoridades del SINA