Es misión del Consejo, promover y participar en la Gestión del Agua en su ámbito territorial, e impulsar las acciones necesarias para preservar el agua, en cantidad y calidad en beneficio de sus habitantes, con el fin de mejorar las condiciones sociales, económicas y ambientales de la cuenca, con la participación de los gobiernos federal, estatal y municipal, usuarios, organizaciones de la sociedad y academia, cumpliendo con lo establecido en la LAN, el Reglamento y las demás disposiciones que emita la Comisión.